南島文化中心於民國103年８月成立，為校內一級學術單位，相較於以單一學院、系所或專班的形式，以研究中心的學術編制來發展臺灣原住民族與世界南島語族的研究與應用有其自由度。南島語族（The Austronesian-speaking peoples）是包含臺灣原住民族在內，說泛南島語之眾多族群的總稱，其分布西自非洲東南的馬達加斯加島，東到復活節島，北起臺灣，南抵紐西蘭島，人口超過兩億人。目前的研究認為臺灣很可能是世界南島語族的起源地，而臺東則是臺灣原住民族族群數最多元，人口數比例也最高的縣市。臺東大學作為臺東地區唯一的大學，成立校級的南島文化中心，冀望結合校內各系所的專業分工以及臺東地區的產、官、學（研）、民等四大面向，聚焦在南島的海洋文化，透過短中長程各階段不同的發展，使臺東大學建立以南島文化為中心的區域文化中心特色，促進地方的文化保存與傳承、文化經營利用與地方發展的多元面向。目前中心的預定辦公與展示空間為臺東校區內的舊圖書館一樓西側位置，除了辦公區域之外，未來也將會結合校內外公私部門，不定期舉辦特展以及各種展演或演講活動，活化南島文化中心的學術與應用角色。

南島文化中心於巴布亞紐幾內亞執行計畫之合影（蔡政良中心主任於左下方）