教育部推動同縣市大專院校合併，台東大學也和台東專科學校接洽，雙方已取得合併共識。這項攸關台東高等教育資源重整的決定，就等教育部點頭。

因台東專科附設高職部，民眾關心地方數千學子升學權益，擔心台東農工因台東大學及台東專科併校而遭裁併。不過，台東專科強調，台東農工不受東大與東專合併影響。

台東專科副校長林景行說，東專原則上同意接受整併，讓專科部升格為技術學院，高職部則比照台東體中附屬，只等細節敲定，再呈報教育部核定。

台東大學表示，教育部當前政策，希望同縣市如有2所國立大學，學生人數卻少於1萬人，優先進行整併，計畫本月送立法院審查，近期大學校長會議中也討論相關問題，以免操作時發生不愉快。

台東大學校長劉金源說，已向教育部口頭說明和東專的整併事宜，細節還待協調，但已取得同意整併的默契，等東專內部先整合意見後再討論。

林景行則說，台東專校內部已取得同意整併的共識。專科部的問題較小，因師資規模和台東大學相近，所以希望成為台東大學人文、理工、師範3學院之外的第4學院。但專科部較傾向技術面，比較可能朝技術學院方向努力。

而現有的高職部則希望比照台東體中，林景行表示不會另外獨立成校或恢復為以往的台東農工，而是成為技術學院的附設高職，高職部學生未來也能和升格後的技術學院銜接。林景行說，台東專校現有情況在全台獨一無二，因全台沒有任何一所專科學校附屬高職部，也成為引發專科與高職部齟齬的根源，期盼能藉這次一併處理。