本校運動與健康中心（簡稱運健中心）之前身為體育室，為營造健康的校園，使『運動與健康』成為東大人的生活方式，102學年度組織名稱更名為「運動與健康中心」，為全國大專校院之首例。本中心之目標，除了透過健康促進及體育活動，凝聚全校向心力外，期能結合臺東自然環境，藉由戶外運動健全學生人格，進而發展本校特色，同時行銷臺東大學。

本中心各項新的運動場館及室內游泳館，自103學年度起搬遷知本校區後已陸續啟用，舉凡運動場館營運與管理之建置、運動賽事與訓練之籌辦、運動與健康教育活動之推廣、健康促進活動與體適能教學之規劃、健康管理與飲食衛生之督導等業務，均在上學年度搬遷試營運後，漸入佳境，未來期望更能活化運動場館，邁向人人運動、時時運動及處處運動之健康校園。

105 年全國大專校院運動會由本校承辦，距上次本校舉辦全大運已是29年前(民76年)，今適逢本校新遷校區，為拓展本校知名度及完善各運動場館設施，全校師生均以歡喜之心迎接盛事。本中心為本校綜理體育教學與賽會活動之業務，肩負協助學校辦理105年全國大專校院運動會之責。104學年度將以籌辦105年全大運為重要目標及首要任務，期能凝聚全校師生、縣府單位及民間組織之力量，攜手合作辦理久違30年的全大運。